1953年清华大学扩招，吴持信考上清华大学电机系，那年与他一同考上清华大学的还有国务院前总理朱镕基的爱人劳安，只不过劳安报考的是发电输配电系。当时，吴持信第一志愿是电机系、第二志愿是建筑系、第三志愿是制药系，结果他被第一志愿录取了，学制5年。朱镕基总理曾经就是电机系的学生，朱镕基应该是他的学长。“那时的朱镕基就很优秀，不仅学习好，还是学校的学生会主席!”吴持信说。
其实，吴持信当年仅仅是初中毕业，之所以能考上大学时因为他在做描图童工的时候，一边工作一边自学高中课程，并到当时的工农兵中学学习。由于吴持信是调干生(从学校工作人员考上的学生)，所以，吴持信一边上大学还一边挣工资，每个月22元。
他平时爱写日记，在大学期间，他一共写了10本日记，至今还保存着一本日记，其他的都已经丢失了。这些日记有的是记录生活的点滴，有的是描写青春的激情。其中，在1951年10月4日的一首小诗这样写道：生命的花朵正在盛放的时节/突然遭到了暴风雨的吹击/脆弱的枝条在狂风中摇摆/软嫩的新叶在恶雨中颤栗/年轻的生命啊!很快的将要毁灭/但是坚强的花朵坚定了信心迎着风雨/吸收了养料培养身躯/渐渐风停了、雨止了。就这样，青春的激情伴着荷塘月色静静地绽放，对未来的美好憧憬也在清华园里尽情开放。
大学毕业后，在大同市一呆就是18年。18年，时代在变化；18年，他也在变化。
在大同工作期间，他正赶上“文革”，每天大字报铺天盖地，他没有加入写大字报的行列，而是独自躲在石头堆后面悄悄看书去了，但那也无法幸免刁难。他的“反动日记”和“地主”的家庭成份，让他成为最早的一批“牛鬼蛇神”，他被“靠边站”了，由大学讲师变成扫厕所、捡大粪的“黑五类”。好在他最早被“打倒”，所以幸免没有被学生“武斗”。
